A Igreja de Santa Clara localiza-se da freguesia da Sé e foi construída mesmo ao lado da parte mais visível das Muralhas Fernandinas, tendo sido concluída em 1457.
A Igreja é de um estilo estrutural Gótico e foi construída após a licença do Vaticano da deslocação da ordem de Entre-os-Rios para dentro das muralhas do burgo. Embora o pedido de deslocação da ordem feminina e encomenda do edifício tenha sido levada a cabo pela monarca D. Filipa de Lencastre, a construção foi terminada pelo seu marido, o rei D. João I.
A entrada desta igreja é da era do Barroco, datada de 1697, tendo sofrido obras de remodelação no século XVIII com elementos renascentistas tais como colunas salomónicas e capitéis coríntios. No seu interior podemos encontrar um dos melhores exemplares da arte de talha dourada do Barroco Joanino da cidade.