A Igreja de S. Francisco foi construída no séc.XIV, no local onde existia um templo humilde que pertencia à ordem dos franciscanos que se tinham estabelecido na cidade do Porto em 1223. A actual é de raiz gótica-mendicante (ou seja, constituída por três naves) tendo sido mais tarde, no período barroco, totalmente preenchida de talha dourada, tornando-se deste modo uma das mais bem trabalhadas e bonitas do Porto, chegando a ser chamada a “Igreja de Ouro”.
Durante as guerras liberais, em 1833, parte do mosteiro foi destruído por causa do pesado fogo das tropas absolutistas, tendo daqui resultado o espaço que viria a ser a praça comercial, na qual se encontra hoje o bonito edifício neoclássico do palácio da bolsa.
Como parte do complexo de edifícios existem também a casa do despacho desenhada por Nicolau Nasoni, as catacumbas, e a igreja da venerável ordem terceira de São Francisco, primeira igreja neoclássica da cidade, onde hoje também existe um museu de arte sacra.
Desde 1910 é Monumento Nacional e desde 1996 Património Cultural da Humanidade.
